Branden blev anmeldt klokken 01.30 natten til fredag, men huset stod ikke til at redde.
Fyns Politi har stærk mistanke om, at branden er påsat.
Der var ingen el-installation eller varmekilde i huset og ejeren har ingen forsikring.
Det er nu op til politiets teknikere at fastslå brandårsagen.
Det er kun en uge siden, at et andet kolonihavehus i haveforeningen Martins Minde, der ligger lige ved siden af Biskorup, nedbrændte og haveforeningen har tidligere været plaget af påsatte brande.